Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PEX2P28328 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms