Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMB9P28065 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms