Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHMLP26374 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHMLP26374 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHMLP26374 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHMLP26374 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHMLP26374 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHMLP26374 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHMLP26374 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHMLP26374 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHMLP26374 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHMLP26374 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHMLP26374 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHMLP26374 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms