Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNMT1P26358 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms