Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD46P15529 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD46P15529 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD46P15529 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD46P15529 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD46P15529 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD46P15529 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD46P15529 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD46P15529 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD46P15529 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD46P15529 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD46P15529 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CD46P15529 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD46P15529 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD46P15529 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD46P15529 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD46P15529 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD46P15529 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CD46P15529 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CD46P15529 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD46P15529 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms