Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HPGDP15428 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HPGDP15428 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HPGDP15428 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms