Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL2P13500 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL2P13500 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL2P13500 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL2P13500 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL2P13500 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL2P13500 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL2P13500 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL2P13500 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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