Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BMP3P12645 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BMP3P12645 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BMP3P12645 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BMP3P12645 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BMP3P12645 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BMP3P12645 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BMP3P12645 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BMP3P12645 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BMP3P12645 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BMP3P12645 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BMP3P12645 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BMP3P12645 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BMP3P12645 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BMP3P12645 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BMP3P12645 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BMP3P12645 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BMP3P12645 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BMP3P12645 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BMP3P12645 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BMP3P12645 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BMP3P12645 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BMP3P12645 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BMP3P12645 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BMP3P12645 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms