Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RLBP1P12271 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms