Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD1P0DJD0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD1P0DJD0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RGPD1P0DJD0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD1P0DJD0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD1P0DJD0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD1P0DJD0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD1P0DJD0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD1P0DJD0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD1P0DJD0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD1P0DJD0 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD1P0DJD0 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD1P0DJD0 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RGPD1P0DJD0 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms