Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VIL1P09327 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VIL1P09327 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VIL1P09327 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VIL1P09327 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VIL1P09327 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VIL1P09327 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VIL1P09327 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VIL1P09327 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VIL1P09327 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VIL1P09327 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VIL1P09327 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VIL1P09327 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VIL1P09327 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms