Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
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PTPRCP08575 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPRCP08575 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRCP08575 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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