Protein–RNA interactions for Protein: O60663

LMX1B, LIM homeobox transcription factor 1-beta, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMX1BO60663 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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LMX1BO60663 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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LMX1BO60663 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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LMX1BO60663 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LMX1BO60663 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMX1BO60663 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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