Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1GO43497 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA1GO43497 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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