Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLOCKO15516 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms