Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCAO15360 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCAO15360 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCAO15360 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCAO15360 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCAO15360 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCAO15360 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCAO15360 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FANCAO15360 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.64
FANCAO15360 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
FANCAO15360 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
FANCAO15360 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCAO15360 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCAO15360 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCAO15360 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCAO15360 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCAO15360 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCAO15360 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCAO15360 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCAO15360 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCAO15360 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCAO15360 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCAO15360 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCAO15360 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCAO15360 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCAO15360 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCAO15360 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCAO15360 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCAO15360 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FANCAO15360 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCAO15360 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCAO15360 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCAO15360 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCAO15360 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCAO15360 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCAO15360 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCAO15360 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCAO15360 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCAO15360 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCAO15360 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCAO15360 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCAO15360 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCAO15360 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FANCAO15360 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FANCAO15360 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms