Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TO15178 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TO15178 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TO15178 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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