Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms