Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MTMR11A4FU01 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms