Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
A3GALT2U3KPV4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.08■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
A3GALT2U3KPV4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms