Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms