Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD54L2Q9Y4B4 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAD54L2Q9Y4B4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms