Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ERGIC3Q9Y282 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms