Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETD1BQ9UPS6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms