Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC12A4Q9UP95 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC12A4Q9UP95 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms