Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TNFSF18Q9UNG2 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TNFSF18Q9UNG2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms