Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC23Q9UJX2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CDC23Q9UJX2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDC23Q9UJX2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDC23Q9UJX2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDC23Q9UJX2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDC23Q9UJX2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDC23Q9UJX2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CDC23Q9UJX2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDC23Q9UJX2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms