Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.05■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DUX4Q9UBX2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DUX4Q9UBX2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms