Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRPC4Q9UBN4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms