Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPARGC1AQ9UBK2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms