Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KCMF1Q9P0J7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms