Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PNPLA3Q9NST1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms