Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS26

SPANXA1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome A, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXA1Q9NS26 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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SPANXA1Q9NS26 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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SPANXA1Q9NS26 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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SPANXA1Q9NS26 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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SPANXA1Q9NS26 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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SPANXA1Q9NS26 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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SPANXA1Q9NS26 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
SPANXA1Q9NS26 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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