Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CHST12Q9NRB3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHST12Q9NRB3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms