Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FZD3Q9NPG1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FZD3Q9NPG1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms