Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CEP44Q9C0F1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms