Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PHACTR1Q9C0D0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms