Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOXF2Q9BQY4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms