Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FYCO1Q9BQS8 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms