Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SH3GL3Q99963 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms