Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms