Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KCNC2Q96PR1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNC2Q96PR1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms