Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EP400Q96L91 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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