Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RFT1Q96AA3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms