Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HGDQ93099 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HGDQ93099 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HGDQ93099 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms