Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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USP9XQ93008 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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USP9XQ93008 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
USP9XQ93008 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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