Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TAF4BQ92750 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms