Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF128Q8TEB7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNF128Q8TEB7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms