Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SEMA6DQ8NFY4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SEMA6DQ8NFY4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SEMA6DQ8NFY4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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