Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CSNK2A3Q8NEV1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CSNK2A3Q8NEV1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CSNK2A3Q8NEV1 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CSNK2A3Q8NEV1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CSNK2A3Q8NEV1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CSNK2A3Q8NEV1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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